OrganisationsCentre Hospitalier Universitaire d'Angers
Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
Etablissement public hospitalier assurant des missions de soins, d'enseignement et de recherche à Angers.
Présentation de Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
Etablissement public hospitalier assurant des missions de soins, d'enseignement et de recherche à Angers.
Projets emblématiques
Projets publics documentés, avec leur source.
Développement et maintenance des outils bioinformatiques pour l'analyse NGS en génétique des cancers
Le projet consiste à assurer la maintenance, la mise à jour et le développement des outils bioinformatiques et pipelines d'analyse pour exploiter les données de séquençage nouvelle génération (NGS) en génétique des cancers. Les analyses concernent la recherche de mutations somatiques, insertions/délétions, nombre de copies sur panels et exomes, fusions d'ARN (panel ARN et WTS) et méthylation (puces Infinium). L'objectif est d'améliorer les performances analytiques et matérielles des outils existants dans le cadre de la démarche qualité (accréditation ISO15189 en cours), de gérer l'infrastructure informatique associée aux séquenceurs NGS et d'assurer l'archivage des données. Le projet s'inscrit dans une dynamique de développement d'une équipe pluridisciplinaire de bio-informaticiens, en lien avec des activités de recherche fondamentale et translationnelle au sein de l'unité INSERM CRCI2NA.
Questions fréquentes
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